Protein–RNA interactions for Protein: Q92673

SORL1, Sortilin-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORL1Q92673 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms