Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms