Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms