Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL22A1Q8NFW1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL22A1Q8NFW1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms