Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms