Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms