Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms