Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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CA13Q8N1Q1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CA13Q8N1Q1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CA13Q8N1Q1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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