Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOT1Q8IXI2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOT1Q8IXI2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms