Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms