Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTOP1Q7RTM1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms