Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP27Q6ZUM4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms