Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRCAPQ6ZRS2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms