Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms