Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED9Q6R2W3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
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