Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATAD2Q6PL18 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATAD2Q6PL18 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms