Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms