Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF40BQ6NWY9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms