Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIRMAQ69YN4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms