Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF123Q5XPI4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms