Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms