Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF18Q5VWM3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF18Q5VWM3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF18Q5VWM3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF18Q5VWM3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms