Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHSL1Q5SYE7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NHSL1Q5SYE7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NHSL1Q5SYE7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms