Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3Q5K4L6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A3Q5K4L6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms