Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms