Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms