Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ESCO2Q56NI9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms