Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms