Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms