Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN2Q504Q3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms