Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC96Q2M329 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms