Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM187BQ17R55 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms