Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FOXD1Q16676 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
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FOXD1Q16676 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
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FOXD1Q16676 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
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FOXD1Q16676 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
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FOXD1Q16676 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
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FOXD1Q16676 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD1Q16676 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
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