Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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