Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP7Q16576 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP7Q16576 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms