Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LY6EQ16553 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms