Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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