Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCF4Q15080 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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