Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms