Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX2Q13950 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX2Q13950 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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