Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
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SHROOM2Q13796 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHROOM2Q13796 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
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