Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATMQ13315 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATMQ13315 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms