Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CALCOCO2Q13137 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CALCOCO2Q13137 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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