Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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