Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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TRAF1Q13077 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF1Q13077 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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TRAF1Q13077 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF1Q13077 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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