Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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