Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRN3Q13033 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRN3Q13033 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms