Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 RPL37AYLR185W 267 nt2.39□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 TIM9YEL020W-A 264 nt2.38□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 RPS24AYER074W 408 nt2.38□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 BUB1YGR188C 3066 nt2.38□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 RPC10YHR143W-A 213 nt2.38□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 RPS22BYLR367W 393 nt2.38□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 TRM7YBR061C 933 nt2.38□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 ASG1YIL130W 2895 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 IES5YER092W 378 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 RRF1YHR038W 693 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YIL058WYIL058W 285 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 HYR1YIR037W 492 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 TIM8YJR135W-A 264 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YLR334CYLR334C 381 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 SIP18YMR175W 240 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 RGM1YMR182C 636 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 SWA2YDR320C 2007 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 POM152YMR129W 4014 nt2.37□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YDR269CYDR269C 324 nt2.36□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.36□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.36□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.36□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YBR032WYBR032W 303 nt2.36□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 TSC3YBR058C-A 243 nt2.36□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YPL261CYPL261C 309 nt2.36□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 PSO2YMR137C 1986 nt2.36□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 EDS1YBR033W 2760 nt2.35□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 snR76snR76 109 nt2.35□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.35□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 MGM1YOR211C 2646 nt2.35□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YHR138CYHR138C 345 nt2.34□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YKL111CYKL111C 336 nt2.34□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 RPL36AYMR194W 303 nt2.34□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 ICY1YMR195W 384 nt2.34□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YOL159CYOL159C 516 nt2.34□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 GPI8YDR331W 1236 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 GIM4YEL003W 336 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YER189WYER189W 369 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YGR025WYGR025W 303 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YGR050CYGR050C 357 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 IRC19YLL033W 693 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YBL012CYBL012C 402 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 SLM6YBR266C 453 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 ECM25YJL201W 1800 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 LEU3YLR451W 2661 nt2.33□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 SWF1YDR126W 1011 nt2.32□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 NCE101YJL205C 162 nt2.32□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 NFU1YKL040C 771 nt2.32□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YML084WYML084W 309 nt2.32□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YOR105WYOR105W 327 nt2.32□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 snR13snR13 124 nt2.32□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 ELG1YOR144C 2376 nt2.32□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 SDC25YLL016W 3147 nt2.32□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 KOG1YHR186C 4674 nt2.31□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 SSY1YDR160W 2559 nt2.31□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 VTC1YER072W 390 nt2.31□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.31□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 CCW14YLR390W-A 717 nt2.31□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.31□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YPR039WYPR039W 336 nt2.31□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 INP53YOR109W 3324 nt2.31□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YPR097WYPR097W 3222 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 PSK2YOL045W 3306 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 NUP82YJL061W 2142 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 HRD3YLR207W 2502 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 RPL40AYIL148W 387 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YLR458WYLR458W 381 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YBR197CYBR197C 654 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 SET2YJL168C 2202 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 BRO1YPL084W 2535 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 HOS4YIL112W 3252 nt2.3□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 BRP1YGL007W 378 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 RAM2YKL019W 951 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YLR031WYLR031W 561 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YAR068WYAR068W 486 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 CRS5YOR031W 210 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YBR285WYBR285W 435 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 COS111YBR203W 2775 nt2.29□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YNL018CYNL018C 1839 nt2.28□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 DIS3YOL021C 3006 nt2.28□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 YJL202CYJL202C 348 nt2.28□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 ZEO1YOL109W 342 nt2.28□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 ERP4YOR016C 624 nt2.28□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 EGD1YPL037C 474 nt2.28□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 MGR1YCL044C 1254 nt2.28□□□□□ -2.04
LSP1Q12230 RGA2YDR379W 3030 nt2.28□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 NIC96YFR002W 2520 nt2.27□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YDL068WYDL068W 330 nt2.27□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 RNP1YLL046C 750 nt2.27□□□□□ -2.05
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