Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms