Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC9Q06265 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms